为更好地开展工程造价纠纷调解工作，加大国有资金投资工程结算审计力度，不断优化我市建筑市场营商环境，南通市住房和城乡建设局、南通市审计局建立和完善了南通市建设工程结算审计造价纠纷调解工作机制，由南通市建设工程造价管理处（以下简称“造价处”）负责对国有资金投资工程结算审计造价纠纷调解工作进行组织和协调。
南通市市区内国有资金投资工程发生结算审计造价纠纷，工程发承包双方通过协商无法达成一致意见的，可向造价处提交调解申请。造价处受理造价纠纷调解后，应安排相关专业人员作为纠纷调解人，召集有关建设各方主体以及相关专家召开纠纷调解会议，达成一致意见后形成会议纪要，经与会各方签章确认后作为该工程造价纠纷调解最终结论和工程结算依据，建设各方主体不得擅自更改。
目前造价处已经协调解决了南通市慈善博物馆、南通市中央创新区创新一小、南通市西站交通枢纽机电工程等10余项工程造价纠纷，顺利推进了工程审计进度。